Deep Sequencing Facility im SFB 655

HiSeq 2000, Illumina

Die Etablierung hochmoderner DNA-Sequenzierungsstrategien – Deep Sequencing bzw. Massively Parallel Sequencing  – in Dresden, ist Teil der SFB-Förderung in der 2. Förderperiode des SFB 655.

Anfang 2011 installierte die neu geschaffene Deep Sequening-Gruppe des SFB den HiSeq 2000 von Illumina. Mittels dieses Geräts wird den SFB–Forschungsgruppen massiv parallelisiertes Short Read Sequencing bis zu einer Leselänge von 2 x 100 bp durch die Deep Sequencing Gruppe zur Verfügung gestellt.

In den letzten Monaten wurden der Laboraufbau intensiv voran getrieben und methodische Vorarbeiten geleistet; erste Experimente mit wissenschaftlichen Kooperationspartnern als auch kommerziellen Partnern wurden durchgeführt.

Die Schwerpunktapplikationen im SFB - RNA-Sequencing und ChiP Sequencing werden somit bereits voll von der Deep Sequencing-Gruppe unterstützt. Ein weiterer Focus liegt auf der Etablierung von preparativen Methoden für kleinste Mengen an biologischem Material, da innerhalb der SFB-Gruppen zu einem Großteil mit kleinsten Mengen biologischen Materials gearbeitet wird.

Ansprechpartner für Nutzer:

Dr. Andreas Dahl, Leiter Deep Sequencing-Gruppe des SFB 655

Tel. +49 (0) 351 463 40 318

Fax.: +49 (0) 351-463 40342

andreas.dahl@biotec.tu-dresden.de